În cadrul Centrului de Analiză și Planificare a Dezvoltării Regionale (C.A.P.D.R.), există mai multe departamente și entități specializate care îndeplinesc roluri specifice în sprijinul misiunii organizației. Aceste departamente au responsabilități distincte și lucrează în diverse domenii pentru a promova oportunitățile investiționale sub spectrul regional, facilitățile privind infrastructura turistică, pentru a deschide piețele externe pentru produsele și serviciile regionale, pentru consilidarea relațiilor bilaterale dintre România și Republica Moldova.
Iată câteva exemple de departamente importante în cadrul CAPDR și rolurile lor:
